西医认为：阴茎的分化与发育全靠体内的睾酮水平，如果妊娠第6－9个月期间，睾酮分泌不足，阴茎发育低于正常速度，出生时阴茎便较小。导致小阴茎的病因包括：病变原发于睾丸的高促性腺激素性腺功能低下症；低促性腺激素性腺功能低下症；部分性抗雄激素综合征；特发性小阴茎，原因至今不明。

　　中医认为：肾为先天之本，主藏精，主司人身的发育成长、生殖和水津诸液。若先天发育不良，必造成阴茎短小不足。另外中医还认为阴茎短小后天多由肾气不足所致，肾气足则气旺，阴茎勃起强大。

　　中西医结合观点：
　　本病中医在临床中认为需要增加阳气，温肾补气，增强性器官的真阳之气使内藏于腹部的阴茎增长出来。西医治疗本病以内分泌治疗和手术治疗为主。